Ο Άγιος Γεράσιμος έφτασε στα Ομαλά το 1560 όπου και ανακαίνισε το ξωκλήσι της Κοιμήσεως της Θεοτόκου, ιδρύοντας παράλληλα γυναικεία κοινοβιακή Μονή με πολυμελή αδελφότητα ονομάζοντάς τη “Νέα Ιερουσαλήμ”.
Τα 40 πηγάδια υπάρχουν μέχρι σήμερα, εκτιμάται ότι είναι ενετικά, παρ’ όλο που η παράδοση υποστηρίζει ότι τα άνοιξε ο ίδιος ο Άγιος. Βρίσκονται σε ένα χωράφι 200 μέτρα περίπου από το Μοναστήρι και σύμφωνα με την παράδοση τα άνοιξε με τα χέρια του ο Άγιος για να βοηθήσει την περιοχή από τη λειψυδρία, όπως και φύτεψε τρία μεγάλα πλατάνια που σώζονται ακόμη.
Στον Β΄ Παγκόσμιο πόλεμο, όταν διαλύθηκε η συμμαχία Ιταλών – Γερμανών μετά την τρομερή σφαγή της Ιταλικής μεραρχίας «Aiqui» στην Κεφαλλονιά από τους Γερμανούς, έγινε κάτι φοβερό. Οι Γερμανοί γέμισαν τα πηγάδια με τα πτώματα των Ιταλών, όπως ιστορούν οι γεροντότεροι.